Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms