Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM60AQ9NP50 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM60AQ9NP50 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM60AQ9NP50 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM60AQ9NP50 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM60AQ9NP50 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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