Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms