Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms