Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms