Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms