Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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CNPPD1Q9BV87 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CNPPD1Q9BV87 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CNPPD1Q9BV87 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNPPD1Q9BV87 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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