Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MESP1Q9BRJ9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MESP1Q9BRJ9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms