Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms