Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms