Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCMH1Q96GD3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms