Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms