Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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