Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms