Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PLD3Q8IV08 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms