Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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