Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBLN3Q6UW01 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms