Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCTN3Q6NUS6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms