Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRHL2Q6ISB3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms