Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NEXMIFQ5QGS0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEXMIFQ5QGS0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms