Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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