Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM187BQ17R55 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms