Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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