Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA9Q16795 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms