Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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