Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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