Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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GRIK5Q16478 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GRIK5Q16478 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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