Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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