Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms