Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms