Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA2Q15822 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms