Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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