Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CDSNQ15517 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CDSNQ15517 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CDSNQ15517 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CDSNQ15517 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CDSNQ15517 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CDSNQ15517 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CDSNQ15517 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CDSNQ15517 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CDSNQ15517 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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