Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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