Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms