Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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