Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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