Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms