Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
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