Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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