Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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