Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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