Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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