Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SP140Q13342 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SP140Q13342 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP140Q13342 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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