Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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