Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CHAF1BQ13112 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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CHAF1BQ13112 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CHAF1BQ13112 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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