Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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FOXF2Q12947 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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