Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms