Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms