Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H3F3AP84243 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H3F3AP84243 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H3F3AP84243 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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